Файлова система може містити віруси та інші небезпечні програми. Шкідливі програми можуть роками зберігатися у вашій файловій системі, проникнувши зі знімного диска або з інтернету, і ніяк не виявляти себе. Проте варто лише відкрити заражений файл або, наприклад, спробувати скопіювати його на диск, вірус тут же проявить себе. 

Файловий Антивірус - компонент, який контролює файлову систему комп'ютера. Він перевіряє все відкривається, запускати і зберігати файли на вашому комп'ютері і всіх приєднаних по мережі дисках. Кожен файл, до якого ви звернетеся, буде перехоплений Антивірусом Касперського і перевірений на присутність відомих вірусів. Подальша робота з файлом можлива тільки в тому випадку, якщо файл не заражений або був успішно вилікували Антивірусом Касперського. Якщо ж файл з яких-небудь причин неможливо вилікувати, він буде вилучений або поміщений на карантин.